朱慈烺有一种预感：鼎鼎大名的龟船，不可能就这样被动挨打。
他的预感很快就得到了验证。
没过多久，两艘龟船抵近了最左边的明军战船，开始发动攻击。
众将终于看清了龟船的样貌，只见每艘龟船的两侧各有大约30多个孔洞。龟船外面看不到人，显然，水手们都躲在龟船内部，通过孔洞不断射出箭只、子弹和炮弹。
有一发炮弹在明军战船上砸了个拳头大的洞，引得众将一阵惊呼。
朱慈烺保持着冷静。在他看来，龟船舱室密闭，空间有限，不可能像明军水师那样装载大型火炮，只能搭载一些小炮，而且数量不会太多。这种炮发射的炮弹很小，对于高大的明军战船来说威胁不大，但如果持续地开炮，明军战船也会有危险。
众将身处岸上，帮不上忙，只能冷眼观战。很快，大家就看出了问题。
首先，当龟船围住了明军第一艘战船后，其他战船无法开炮支援。这跟陆地上的情况不同，明军战船目标大，龟船目标小，其他战船如果开炮，很可能会击中自家战船，而不是命中龟船。
其次，第一艘战船单靠自己的力量，反击乏术。
战船最主要的武器是船头的巨型火炮，其优点是射程远、火力强。但是当龟船抵近以后，巨型火炮就派不上用场了。
这时，战船上的炮手们调集了一些小型火炮朝下射击，但龟船顶上有铁板防护，挨几下问题不大，此外还不断灵活移动来躲避炮火。明军水手们则主要依靠弓箭进行反击，但龟船是全封闭的，因此收效甚微。
然而，龟船里的弓箭手和火绳枪手们却不断从孔洞里向外射击，明军战船上持续有人倒下。这就成了一场不平衡的战斗，敌人能击中我，我却基本上打不着敌人。
其实，当敌我双方的船靠近时，跳帮战是一个好办法。然而众将发现，龟船顶上不仅覆盖了铁板，而且还密布铁锥，明军水手如果跳过去，肯定会被当场扎死。看来龟船在设计之初就考虑到了要防止跳帮战，因此这一招也不管用了。
更可怕的是，龟船还从顶部喷出毒雾，吹向明军战船。很快，明军水手不断有人晕倒，连岸上的众将都闻到了一股浓烈的硫磺味。而龟船由于是封闭的，因此不会受到影响。
看到这一幕幕，众将有些傻眼：龟船简直是刀枪不入，而且攻击的招数也是花样翻新，这仗还怎么打？
朱慈烺也意识到，这种近战缠斗正合朝鲜水师之意，却不适合明军水师。他连忙让旗语兵下令：全体战船赶紧撤退，跟龟船脱离接触。
正在旗舰上指挥的郑成功也正有此意，收到命令后，立刻率领战船南撤。
虽然后面7艘战船得以摆脱龟船堵截，然而第一艘战船已经被10多艘龟船团团围住，已经动弹不得。
这些龟船在第一艘战船周围来回穿梭，一边躲避战船上的小型火炮，一边对战船开炮，战船的船身被砸出了越来越多的洞。
终于，第一艘战船开始下沉，最终没入水中。
看到龟船在自己眼前横行，马科怒了：“大帅，我们得教训一下这些龟儿子。”
朱慈烺问道：“怎么教训？”
马科迟疑了一下：“放箭。”
“战船上的水手一直在放箭啊，有用吗？”
“这……”
岸上的明军拿龟船也没办法，然而龟船却盯上了岸上的明军。
原来，龟船见明军水师的7艘战船已经突围，一时追赶不上，而被包围的那艘战船已经沉没，便转而将目标对准了岸上的明军，箭、子弹、炮弹朝岸上飞来，明军士兵纷纷倒地。
朱慈烺吓了一跳，没想到龟船竟然主动攻击起岸上的明军来了，然而他一时也不知道如何反击，只好惹不起躲得起，下令所有人撤离岸边。
就这样，三角山一带的沿岸都被龟船占据了。这里的临时码头是补给船队及郑成功的水师停靠的地方，这下可好，水师的老巢都被人端了。朱慈烺深感羞辱，他要想办法赶跑这些龟船。
眺望大海，他看到郑成功的水师还剩7条战船，目前已经远离了龟船。但他不能命令水师朝这些龟船开炮，因为龟船已经离明军大营很近，万一炮弹落到了大营里，会炸死很多将士的。
怎么办？
朱慈烺往更远的地方望去，看见了好几艘朝鲜水师的板屋船。那些船一直远远跟着，并没有靠前。
朱慈烺敏锐地感觉到，这几艘板屋船可能是朝鲜水师的指挥船，之所以没有跟过来，大概是为了保证船上指挥官的安全。想到这里，他有了主意。
他让旗语兵给郑成功下令：全力攻击板屋船！
郑成功收到命令后，率领全部7艘战船，朝着板屋船开去。
旺吉努此时就在最中间的那艘板屋船上，看到朝鲜水师的龟船击沉了一艘明军战船，他大喜过望。
虽然朝鲜水师也损失了3艘龟船，但对旺吉努来说，由于每艘龟船上只有1名督战的清兵，其他全都是朝鲜水手，这就相当于他只付出了3名清兵的代价，就干掉了一艘明军战船，还有比这更划算的买卖吗？凭着这个战绩，完全可以向多尔衮邀功了。
旺吉努正志得意满，手下向他报告：“大人，明军战船正在向我们靠近。”
旺吉努顺着手下所指的方向看去，果然发现有7艘战船正朝他驶来。
旺吉努慌了手脚，连声命令：“快撤！快！”
然而板屋船的航速实在有些慢，明军战船越来越近。旺吉努连忙让旗语兵给那些龟船下令：赶快过来保护板屋船。
云集在三角山沿岸的众多龟船转眼间就向东撤退了，它们要赶去阻截明军战船。
朱慈烺见状，派出会水的明军士兵下海，尽量将落水的明军水手救上岸来。
此时在海上，明军战船已经迫近了板屋船，郑成功下令开炮。
这些板屋船不仅目标大，而且防护也远不及龟船，只要挨上一炮，就死伤惨重，再挨上一、两炮，便开始下沉。
在隆隆的炮声中，有两艘板屋船沉入了渤海。
郑成功本想再靠近一些，用跳帮战的办法消灭这些板屋船，然而他看到龟船正先后赶到，如果纠缠下去，恐怕会像第一艘战船那样，陷入被龟船包围的危险境地，于是他下令停止追击，跟敌船保持距离。
旺吉努的板屋船侥幸逃过了明军战船的炮击，见龟船前来汇合，旺吉努这才松了口气，下令全军撤回旅顺港休整。